Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL9A2Q14055 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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