Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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PDE6HQ13956 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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