Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SPTAN1Q13813 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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