Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SHROOM2Q13796 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SHROOM2Q13796 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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SHROOM2Q13796 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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SHROOM2Q13796 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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SHROOM2Q13796 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SHROOM2Q13796 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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SHROOM2Q13796 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SHROOM2Q13796 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SHROOM2Q13796 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SHROOM2Q13796 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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