Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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