Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NEUROD1Q13562 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NEUROD1Q13562 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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