Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATRQ13535 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ATRQ13535 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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