Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TCOF1Q13428 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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TCOF1Q13428 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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TCOF1Q13428 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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TCOF1Q13428 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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