Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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SKP2Q13309 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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