Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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