Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms