Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms