Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRDNQ13061 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms