Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK2Q13002 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 556.6 ms