Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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FOXC1Q12948 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXC1Q12948 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXC1Q12948 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXC1Q12948 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXC1Q12948 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXC1Q12948 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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FOXC1Q12948 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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FOXC1Q12948 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXC1Q12948 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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