Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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