Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TROQ12816 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TROQ12816 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TROQ12816 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TROQ12816 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TROQ12816 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TROQ12816 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TROQ12816 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TROQ12816 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TROQ12816 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TROQ12816 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TROQ12816 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TROQ12816 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TROQ12816 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TROQ12816 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TROQ12816 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TROQ12816 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TROQ12816 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TROQ12816 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TROQ12816 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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