Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C1Q12789 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms