Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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