Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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