Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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HOXD1Q9GZZ0 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD1Q9GZZ0 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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