Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMG1Q96Q15 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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