Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TRIM63Q969Q1 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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TRIM63Q969Q1 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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TRIM63Q969Q1 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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TRIM63Q969Q1 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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TRIM63Q969Q1 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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TRIM63Q969Q1 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRIM63Q969Q1 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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