Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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