Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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PTPRNQ16849 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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