Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLPPQ16740 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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