Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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