Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PDK4Q16654 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PDK4Q16654 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PDK4Q16654 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PDK4Q16654 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PDK4Q16654 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms