Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNXAQ16473 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms