Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F4Q16254 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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E2F4Q16254 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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