Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERC1Q15751 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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