Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.3 ms