Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms