Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TAF1AQ15573 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms