Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHHQ15465 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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SHHQ15465 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SHHQ15465 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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SHHQ15465 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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SHHQ15465 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SHHQ15465 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHHQ15465 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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