Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SYCP1Q15431 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SYCP1Q15431 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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