Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RAB39AQ14964 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms