Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GPNMBQ14956 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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GPNMBQ14956 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
GPNMBQ14956 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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GPNMBQ14956 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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