Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms