Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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