Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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COL9A3Q14050 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL9A3Q14050 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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