Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
APOFQ13790 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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APOFQ13790 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
APOFQ13790 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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