Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDH18Q13634 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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