Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATRQ13535 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATRQ13535 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATRQ13535 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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