Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PRPF4BQ13523 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms