Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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TCIRG1Q13488 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCIRG1Q13488 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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