Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms