Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CBX3Q13185 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CBX3Q13185 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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CBX3Q13185 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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CBX3Q13185 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
CBX3Q13185 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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