Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CALCOCO2Q13137 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CALCOCO2Q13137 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms