Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms